Outre la participation à des projets de recherche multicentriques et l'aide logistique aux équipes locales, le CIC a surtout axé son développement autour de ses propres thématiques de recherche. Un équilibre a été trouvé entre la recherche industrielle et la recherche institutionnelle afin de maintenir un niveau d'autofinancement mais aussi de production scientifique adéquats.
Le CIC oriente sa recherche clinique autour de quatre axes qui allient recherche clinique et fondamentale :